Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms