Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xrcc1Q60596 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms