Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

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Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf123Q5XPI3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf123Q5XPI3 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf123Q5XPI3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf123Q5XPI3 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf123Q5XPI3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf123Q5XPI3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf123Q5XPI3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms