Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Nod2-201ENSMUST00000054324 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Csf2rb2-201ENSMUST00000096356 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gm46404-201ENSMUST00000221461 4114 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Klhdc7a-201ENSMUST00000105031 7807 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Manba-201ENSMUST00000029814 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Epb42-202ENSMUST00000102490 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Cntrl-202ENSMUST00000028237 7615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Mid1-205ENSMUST00000112105 3974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gria4-201ENSMUST00000027020 5441 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defa20Q45VN2 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms