Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 D330050G23Rik-202ENSMUST00000128305 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinb6d-202ENSMUST00000221681 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gtpbp6Q3U6U5 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gtpbp6Q3U6U5 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gtpbp6Q3U6U5 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm11827-201ENSMUST00000142297 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gtpbp6Q3U6U5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm8857-201ENSMUST00000170064 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 BC060293-201ENSMUST00000207005 1104 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 AC107711.6-201ENSMUST00000228455 1088 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms