Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ctdnep1Q3TP92 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ctdnep1Q3TP92 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctdnep1Q3TP92 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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