Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim24Q0VG18 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms