Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms