Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rundc1Q0VDN7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms