Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RptnP97347 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms