Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irx1P81068 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms