Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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