Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms