Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd13P70217 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms