Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rps29P62274 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms