Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Irf5P56477 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Irf5P56477 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Irf5P56477 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Irf5P56477 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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