Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gp1bbP56400 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms