Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 A630012P03Rik-202ENSMUST00000114854 1974 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms