Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ClgnP52194 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ClgnP52194 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
ClgnP52194 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms