Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sept1P42209 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sept1P42209 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms