Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Usp4P35123 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp4P35123 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp4P35123 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp4P35123 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp4P35123 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp4P35123 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp4P35123 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp4P35123 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp4P35123 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp4P35123 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp4P35123 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp4P35123 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp4P35123 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usp4P35123 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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