Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TP20293 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TP20293 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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