Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
VimP20152 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 2900060N12Rik-201ENSMUST00000221412 3721 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VimP20152 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VimP20152 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms