Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Rps6kc1-201ENSMUST00000061611 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Osmr-204ENSMUST00000176826 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Epn2-213ENSMUST00000179936 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Acad10-201ENSMUST00000031412 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Olfr429-202ENSMUST00000216346 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Fkbp5-206ENSMUST00000177939 3844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms