Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P10404 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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P10404 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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P10404 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P10404 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P10404 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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