Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Sgsh-201ENSMUST00000005173 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Nedd4l-211ENSMUST00000226058 3393 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 A230056P14Rik-201ENSMUST00000130189 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm5114-201ENSMUST00000108017 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm38148-201ENSMUST00000195166 3012 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Mir8113-201ENSMUST00000184956 129 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm18289-201ENSMUST00000203356 2989 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Fam124b-201ENSMUST00000058748 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Best3-201ENSMUST00000020378 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Cwc22-201ENSMUST00000065889 3471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Hapln3-203ENSMUST00000206092 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Snx25-201ENSMUST00000041582 3206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Sulf1-203ENSMUST00000180062 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Nrf1-205ENSMUST00000115200 2491 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm44812-201ENSMUST00000207627 5349 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 AU018091-201ENSMUST00000171749 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Ect2l-203ENSMUST00000207827 2730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Hmgcs2-201ENSMUST00000090746 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Ankmy1-201ENSMUST00000112998 3243 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Limk2-202ENSMUST00000101640 3711 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Washc4-201ENSMUST00000038388 5858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 4930407I10Rik-201ENSMUST00000100396 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Nim1k-201ENSMUST00000178142 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 C1ra-201ENSMUST00000068593 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Vmn1r181-202ENSMUST00000226843 4496 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 AC138284.4-201ENSMUST00000216704 2882 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Bcl6b-201ENSMUST00000000326 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ndufb1P0DN34 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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