Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms