Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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