Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms