Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms