Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm9578-201ENSMUST00000182354 753 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cfap46E9Q2C0 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms