Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms