Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

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Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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PtprbB2RU80 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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PtprbB2RU80 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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PtprbB2RU80 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
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PtprbB2RU80 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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PtprbB2RU80 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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PtprbB2RU80 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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PtprbB2RU80 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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