Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms