Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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PtprsB0V2N1 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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PtprsB0V2N1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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PtprsB0V2N1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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PtprsB0V2N1 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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PtprsB0V2N1 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprsB0V2N1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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