Protein–RNA interactions for Protein: A1L0T3

Ssc4d, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc4dA1L0T3 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssc4dA1L0T3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssc4dA1L0T3 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms