Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms