Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms