Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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