Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc97Q9DBT3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms