Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
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