Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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