Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc3Q9CWU5 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms