Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ncbp2Q9CQ49 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms