Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rnf17Q99MV7 Gm16499-201ENSMUST00000204648 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rnf17Q99MV7 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Gm30652-201ENSMUST00000199103 430 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rnf17Q99MV7 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rnf17Q99MV7 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf17Q99MV7 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf17Q99MV7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf17Q99MV7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf17Q99MV7 Wdr17-204ENSMUST00000129132 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf17Q99MV7 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf17Q99MV7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Rnf17Q99MV7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf17Q99MV7 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf17Q99MV7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gm37145-201ENSMUST00000193540 2756 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf17Q99MV7 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf17Q99MV7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf17Q99MV7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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