Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pagr1aQ99L02 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms