Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apobec3Q99J72 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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