Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc28aQ8CEI3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms