Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms