Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms